اولین گزارش از ویروس نوار زرد موسیر (SYSV) از سیر در ایران
عنوان دوره: بیست و دومین کنگره گیاهپزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
سیر (Allium sativum) از جمله گیاهان دارویی است که دارای ترکیبات مختلف از جمله ویتامین های C،A ،B6 ،B2، B1، آلیسین (Allysine)، آجوئن ((Ajoene، ترکیبات سولفور و آنتی اکسیدان ها می‌باشد. اکثر ارقام سیر عقیم بوده و بذر تولید نمی‌کنند و تنها راه تکثیر استفاده از سوخ‌ها است. روش تکثیر غیر جنسی در سیر منجر به تجمع ویروس‌ها در مواد گیاهی شده، انتشار آن‌ها را تسهیل و در طی کشت و کار موجب کاهش محصول می‌شود. به منظور بررسی وضعیت آلودگی‌های ویروسی گیاه سیر تعداد 30 نمونه دارای علائم موزائیک و زردی در پائیز 1394 از شهرستان تنکابن جمع آوری گردید. نمونه‌های جمع آوری شده با استفاده از آزمون ساندویچ دو طرفه الیزا (DAS-ELISA) جهت بررسی وجود یا عدم وجود آلودگی به ویروس با آنتی بادی‌های چند همسانه‌ای ویروس موزائیک خیار(Cucumber mosaic virus, CMV)، ویروس موزائیک گوجه فرنگی (Tomato mosaic virus, ToMV)، ویروس موزائیک توتون (Tobacco mosaic virus, TMV)، ویروس پژمردگی لکه‌ای گوجه فرنگی (Tomato spotted wilt virus, TSWV)، ویروس موزائیک آرابیس (Arabis mosaic virus, ArMV)، ویروس رگه‌ای توتون (Tobacco streak virus, TSV)، ویروس جغجغه‌ای توتون (Tobacco rattle virus, TRV)، ویروس لکه حلقوی توتون (Tobacco ringspot virus,TRSV)، ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی (Tomato ringspot virus, ToRSV) و آنتی بادی جنس پوتی ویروس (Potyvirus)، تهیه شده از DSMZ آلمان مورد ارزیابی قرار گرفتند. از بین نمونه‌های جمع آوری شده آلودگی هفت نمونه به پوتی ویروس تایید و یک جدایه برای بررسی بیشتر انتخاب شد. جهت ردیابی دقیق‌تر ویروس در نمونه آلوده از آزمون RT-PCR استفاده شد. برای این منظور total-RNA جدایه انتخاب شده با استفاده از کیت تجاری شرکت سینا ژن (RNX-plus) استخراج و طی آزمون RT-PCR، قسمتی از ژنوم ویروس به طول 680 نوکلئوتید، مربوط به بخشی از چارچوب ژنی پروتئین پوششی ویروس با استفاده از آغازگرهای WCIEN/Oligo -dT تکثیر شد. قطعه تکثیر شده درون پلاسمید pGEM-T Easy Vector (Promega, USA) همسانه سازی و سپس به سلول‌های مستعد Escherichia coli سویهDH5α منتقل گردید. جهت حصول اطمینان از قرار گرفتن قطعه مورد نظر درون حامل، تجزیه تحلیل پلاسمید نوترکیب خالص سازی شده با استفاده از آنزیم‌های برشی انجام و توالی قطعه تکثیری تعیین گردید. مقایسه توالی نوکلئوتیدی قطعه مورد نظر با سایر توالی‌های مرتبط در GenBank با نرم افزار BLASTn حاکی از بیشترین یکسانی (%88-86%) توالی آن با چارچوب ژنی پروتئین پوششی سایر جدایه‌های ویروس نوار زرد موسیر (Shallot yellow stripe virus, SYSV) بود. توالی نوکلئوتیدی جدایه ایرانی To-SYSV به همراه سایر توالی‌های موجود در GenBank با نرم افزار MEGA6 هم ردیف سازی شده و سپس درخت فیلوژنتیکی ترسیم شد. درخت فیلوژنتیکی ترسیم شده نشان داد جدایه To-SYSV ایرانی با جدایه‌ای از کشور چین با رس شمار NC007433 از میزبان پیازچه (Welsh onion) در یک زیر گروه قرار گرفتند. براساس اطلاعات موجود، این اولین گزارش از وقوع SYSV در ایران است.
کلیدواژه ها