اولین گزارش از قارچ Curvularia buchloes همراه با علائم لکه برگی ذرت از ایران
عنوان دوره: بیست و دومین کنگره گیاهپزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
جنس Curvularia از آسکومیست‌های متعلق به خانواده‌ی Pleosporacae است که میتواند به صورت آندوفیت، اپی‌فیت، ساپروفیت و یا از بیمارگرهای مهم گیاهی باشد. این جنس شامل شمار زیادی از بیمارگرهای قارچی است که همراه علائم لکه برگی، سوختگی و بلایت برگی، پوسیدگی طوقه و ریشه و بسیاری از علائم دیگر و با پراکنش وسیع تقریباً در سراسر دنیا گزارش شده است و میتواند موجب خسارت و کاهش عملکرد محصولات کشاورزی شود. همچنین، برخی از گونه‌های این جنس بیمارگر انسانی هستند. در طی این پژوهش به‌منظور ردیابی و آنالیز فیلوژنی قارچ‌های احتمالی همراه با علائم لکه برگی ذرت در استان خوزستان، در طی سال 1394، از منطقه‌ی حمیدیه، تعدادی نمونه گیاهی ذرت (Zea mays) دارای لکه‌هایی روی برگ‌ها، ساقه و غلاف برگ‌ها، جمع‌آوری و به آزمایشگاه منتقل گردید. جهت جداسازی عوامل بیمارگر احتمالی، قطعات گیاه آلوده به اندازه‌ی 5/0 تا 1 سانتی‌متر از حاشیه‌ی بافت سالم و آلوده در هیپوکلریت سدیم 1٪ ضدعفونی سطحی و پس از شست‌و‌شو و خشک‌کردن در محیط کشت غذایی سیب‌زمینی-دکستروز-آگار (PDA) قرار داده شدند. پس از رشد و جداسازی پرگنههای قارچی، خالص‌سازی به روش تک‌اسپور کردن انجام گرفت. در بررسی خصوصیات ریختشناسی جدایه‌ها، مشخص شد که چند جدایه متعلق به جنس Curvularia میباشند. جهت شناسایی مولکولی جدایه‌ها در سطح گونه، توده‌ی میسلیومی رشد کرده در محیط کشت مایع سیب‌زمینی-دکستروز-برث (PDB)، خشک-انجمادی و در ازت مایع پودر شد. استخراج DNA از بافت پودر شده قارچی با استفاده از روش ریدر و برودا (1985) با اندکی تغییر صورت پذیرفت. واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز با جفت آغازگرهای عمومیITS1 و ITS4 جهت تکثیر نواحیITS انجام شد. قطعات تکثیری حاصل که روی ژل الکتروفورز، باندی با اندازه‌ی تقریبی 600 جفت باز تولید نمودند، با استفاده از روش رسوب DNA با اتانول مطلق، خالص‌سازی و سپس توالی‌یابی گردیدند. یک ترادف نوکلئوتیدی بعد از ویرایش با شماره دسترسی KX139031 در بانک ژن ثبت شد. جستجوی بلاست جهت بررسی میزان شباهت توالی نوکلئوتیدی جدایههای مذکور با توالی-های مربوط به استرین مرجع موجود در بانک ژن انجام شد که بر اساس آن، توالی‌های مربوط به جدایههای مورد بررسی، با استرینهای مرجع گونه‌ی Curvularia buchloes از جمله استرین C. buchloes CBS246.49 (Ac. No. KJ909765) شباهت 100-99 درصدی نشان دادند. آنالیز فیلوژنتیکی مبتنی بر ناحیه‌ی ITS جدایههای حاصل در این مطالعه، به همراه توالی‌های مربوط به استرین تیپ با استفاده از الگوریتم درست‌نمایی بیشینه، تعلق آن‌ها را به این گونه تأیید نمود. براساس دانش ما، این اولین گزارش از وقوع گونه C. buchloes از ایران است.
کلیدواژه ها