مطالعه مقدماتی فیلوژنتیکی برخی از جدایه‌های جنس Xylaria در شمال ایران
عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
به منظور شناسایی مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی برخی جدایه‌های جنس Xylaria در شمال ایران، توالی‌های ناحیه ITS rDNA (شامل 5.8S) 11 جدایه از گونه مرکب X. polymorpha، پنج جدایه X. cubensis و سه جدایه X. pannosa به همراه هشت توالی معتبر گرفته شده از بانک ژن مورد بررسی قرار گرفتند. DNA کل جدایه‌ها از محتویات داخل پریتسیوم یا از آنامورف تشکیل شده در محیط کشت با استفاده از Chelex 5% استخراج و با یکی از جفت آغازگر‌های ITS1F/ITS5/ITS1 و ITS4 تکثیر و توالی‌یابی شد. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی با استفاده از نرم افزارMEGA 5.0 انجام شد. از توالی‌های Hypoxylon fragiforme و Camillea oburia به دست آمده از بانک ژن به عنوان گروه‌های خارجی استفاده شد. نتایج اولیه نشان داد که توالی ناحیه ITS می‌تواند گونه مرکب X. polymorpha را از سایر گونه‌های نزدیک به آن تشخیص دهد ولی به تنهایی جهت تفکیک اعضای این گونه مرکب از یکدیگر کافی نیست. جدایه‌های X. cubensis و X. pannosa نیز در یک گروه قرار گرفتند، بنابراین به نظر می‌رسد که ویژگی‌های ریخت‌شناسی ایکه تاکنون در کلید‌های شناسایی معمول جهت تفکیک این دو گونه استفاده می‌شدند کافی نیستند یا ممکن است این دو گونه مترادف هم باشند.
کلیدواژه ها