تعیین مشخصات ملکولی جدایه ایرانی ویروس ای مو

عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران

ویروس ای مو، عضو تیپ ویتی ویروس، یکی از معمول ترین ویروس های آلوده کننده مو در دنیا است. مطالعات قبلی نشان دهنده وقوع و شیوع بالای این ویروس در برخی استان های کشور است. با این حال اطلاعی از ترادف این ویروس در کشور در دست نیست. در این تحقیق از یک مو آلوده از سعادت شهر استان فارس (IR-S7) که علایم پیچیدگی برگ نشان می داد به عنوان منبع ویروس استفاده شد. آر ان ای کل از بافت پوست گیاه آلوده با استفاده از گوانیدین هیدروکلرید استخراج شد و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی سه ناحیه از ژنوم این ویروس که نواحی RdRp،CP ،و P10 را کد می کنند تکثیر گردید. پس از تعیین ترادف بخش های مختلف ژنوم با کیت همسانه سازی فرمنتاز، ترادف های بدست آمده با استفاده از موتور جستجوی BLAST با ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه گردید. .همردیف سازی و مقایسه ترادف ها با نرم افزار MEGA6 و روش Maximum Likelihood صورت گرفت. نتایج بررسی نشان داد که تنوع قابل ملاحضه ای بین جدایه ایران و جدایه موجود در بانک ژن وجود دارد. میزان یکسانی ترادف در سطح نوکلئوتید در مورد RdRp 1/76 تا 3/83، در CP8/76 تا 4/90 و در P10 6/85 تا 9/95 بود. درخت قیلوزنتیک بازسازی شده از ترادف پروتئینی ژنP10 جدایه ایران و جدایه های موجود در بانک ژن نشان داد که جدایه ایرانی ویروس ای مو متعلق به گروه یک می باشد. با این حال در آنالیز درخت فیلوژنی بدست آمده از ژن RdRp، جدایه ایران به همراه جدایه های متعلق به آفریقای جنوبی در گروه 2 قرار گرفتند. جالب ابنکه در آنالیز فیلوژنی CP، این جدایه در یک خط سیر جدا از سایر جدایه ها قرار گرفت. نتایج بدست آمده از این تحقیق می تواند منجر به بهبود روش های ردیابی و کنترل این ویروس شود.

ویروس ای مو؛ ویتی ویروس؛ جدایه ایرانی؛ فیلوژنی